Alguns metabólitos produzidos por fungos, conhecidos como micotoxinas, são deletérios e causam desde alterações metabólicas a carcinogênese. Casos da Medicina Veterinária, como as aflatoxinas, ergotamina e a zearalenona, são conhecidos e estudados, principalmente em animais de produção.
Entretanto, aspectos como: grande quantidade de micotoxinas, custos, muitas vezes, onerosos na sua identificação, poucos relatos na literatura e estudos conduzidos, frequentemente, com apenas um tipo de micotoxina, constroem um cenário em que o conhecimento clínico existente das micotoxinas ainda seja pequeno e não condizente com a realidade.
Diversos fungos e micotoxinas já foram detectados em grãos e frutas oferecidos na alimentação das aves, o que faz das micotoxicoses um capítulo que não deve ser esquecido na clínica. Como a porta de entrada é por via oral, o trato gastrintestinal é o primeiro sistema exposto. As lesões variam de desequilíbrio osmótico e manutenção das membranas até necrose, podendo estar associados às infecções bacterianas, causando, assim, um quadro de enterite.
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